Prenillangan flavin mononukleotidi - Prenylated flavin mononucleotide - Wikipedia

Prenillangan flavin mononukleotidi
Identifikatorlar
3D model (JSmol )
Xususiyatlari
C22H29N4O9P2
Molyar massa524.466 g · mol−1
Boshqacha ko'rsatilmagan hollar bundan mustasno, ulardagi materiallar uchun ma'lumotlar berilgan standart holat (25 ° C [77 ° F], 100 kPa da).
Infobox ma'lumotnomalari

Prenillangan flavin mononukleotidi (prFMN) bu a kofaktor UbiX flavin preniltransferaza tomonidan ishlab chiqarilgan va UbiD fermentlari tomonidan qaytariladigan dekarboksilazlar vazifasida foydalanilgan, shuning uchun prFMN hamma joyda joylashgan mikrobial UbiDX tizimidagi kataliz uchun juda muhimdir.[1].prFMN bu flavin to'rtinchi aromatik bo'lmagan halqa hosil bo'lishiga olib keladigan N5 va C6 holatlarida prenillangan (1-rasm)[2] prFMN 2015 yilda kashf etilgan Manchester universiteti tomonidan Devid Leys guruh[2][3].

Shakl 1. FMN va prFMN tuzilishiiminium. Eng chap strukturada FMN (Flavin mononukleotid), o'ng tomonda esa prFMN ko'rsatilganiminium (prenillangan flavin mononukleotidi), prFMN da to'rtinchi uglerod (C3 ’) mavjudligiga e'tibor bering.iminium kofaktor prenilatsiyasining ko'rsatkichi.

2015 yilda o'tkazilgan ikkita tadqiqot UbiXni flavin preniltransferaza sifatida tavsiflab, UFI / UBga prFMN etkazib berdi.Fdc1 a katalizatsiyalash uchun kofaktordan foydalanadi qaytariladigan dekarboksilatsiya reaktsiya[2][3]. Ferul kislotasi dekarboksilaza (Fdc1) dan A. niger bilan birgalikda ifoda etilgan E.coli UbiX bilan E.coli (AnFdc1UbiX) bir marta tozalangan holda, aniq ifodalangan AnFdc1 uchun aniq spektral farqlar mavjud edi va bunga qodir edi in vitro qatorining dekarboksillanishi aromatik karboksilik kislotalar. Ning atom rezolyutsiyasi kristall tuzilishi AnFdc1UbiX, prFMN deb tasniflangan modifikatsiyalangan FMN kofaktorining tuzilishini yoritishga ruxsat berilgan (2-rasm). Kristal tuzilishida FMN ning N5-C6 ga izopentenil-addukt aniqlandi, modifikatsiyalari tarvaqaylab tabiat va flavin bilan kovalent bog'lanish holati prenilatsiya.

Shakl 2. prFMNiminium AnFDC1-ning faol saytida. PDB fayli: 4ZA4.

PrFMNHo‘kiz

UbiX / prFMN tomonidan UbiD faollashuvi kislorodga bog'liq bo'lib, UbiX ning kamaytirilgan prFMN mahsuloti katalitik ahamiyatga ega bo'lgan shaklga oksidlanishini anglatadi. Oksidlangan prFMN (prFMN) ning bir nechta o'zgarishiho'kiz) kofaktor kuzatildi: prFMNiminium, gidroksillangan prFMNiminium va prFMNketimin. PRFMNni aniqlash izomer bu katalitik jihatdan AnFdc1 inkubatsiyasiga tegishli ediUbiX bilan fenilpiruvat (ulardan ozgina qismi a-gidroksitsinnam kislotasi bilan chambarchas o'xshaydi dolchin kislotasi - model substrat). Fenilpiruvat bilan inkubatsiya UV-Vis spektrining o'zgarishiga va qaytariladigan ferment inhibisyoniga olib keladi. AnFdc1 ning kristalli tuzilishiUbiX fenilpiruvat bilan prFMN ning C1 'orasidagi bog'lanishni aniqladiiminium va fenilasetaldegid qo'shimchasi - a-gidroksitsinamik kislotani dekarboksilatsiyalash natijasida hosil bo'ladigan tur va tautomerizatsiya a-gidroksistirol prFMN dan iboratiminium qo'shib qo'yish.

Ushbu kuzatish prFMN ekanligini tasdiqladiiminium bu katalitik jihatdan tegishli kofaktor.

Adabiyotlar

  1. ^ Leys, Devid (dekabr 2018). "Flavin metamorfozi: prenilatsiya orqali kofaktor transformatsiyasi". Kimyoviy biologiyaning hozirgi fikri. 47: 117–125. doi:10.1016 / j.cbpa.2018.09.024. PMID  30326424.
  2. ^ a b v Oq, Mark D .; Peyn, Karl A. P.; Fisher, Karl; Marshall, Stiven A.; Parker, Devid; Rattray, Nikolas J. V.; Trivedi, Drupad K.; Goodacre, Royston; Rigbi, Stiven E. J.; Srutton, Nayjel S.; Xey, Sem; Leys, Devid (2015 yil 17-iyun). "UbiX - bakterial ubiquinone biosintezi uchun zarur bo'lgan flavin preniltransferaza". Tabiat. 522 (7557): 502–506. Bibcode:2015 Noyabr 522..502W. doi:10.1038 / tabiat14559. PMC  4988493. PMID  26083743.
  3. ^ a b Peyn, Karl A. P.; Oq, Mark D .; Fisher, Karl; Xara, Basile; Beyli, Samuel S.; Parker, Devid; Rattray, Nikolas J. V.; Trivedi, Drupad K.; Goodacre, Royston; Beveridj, Rebekka; Barran, Perdita; Rigbi, Stiven E. J.; Srutton, Nayjel S.; Xey, Sem; Leys, Devid (2015 yil 17-iyun). "Yangi kofaktor 1,3-dipolyar sikloidlyuksiya orqali a, b-to'yinmagan kislota dekarboksilatsiyasini qo'llab-quvvatlaydi". Tabiat. 522 (7557): 497–501. Bibcode:2015 Noyabr 522 ... 497P. doi:10.1038 / tabiat14560. PMC  4988494. PMID  26083754.