IRGM - IRGM

IRGM
Identifikatorlar
Taxalluslar	IRGM, IFI1, IRGM1, LRG-47, LRG47, immunitet bilan bog'liq GTPaza M, immunitet bilan bog'liq GTPaza M
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 608212 MGI: 1926262 HomoloGene: 78363 Generkartalar: IRGM
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 5 (odam)
Oxiri	150,900,736 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 11 (sichqoncha)
Oxiri	58,222,782 bp
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• nukleotid bilan bog'lanish; • GTP majburiyligi; • gidrolaza faolligi; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • protein kinaz bilan bog'lanish; • oqsil serin / treonin kinaz faollashtiruvchisi faoliyati; • CARD domeni majburiy; • BH3 domenini bog'lash; • GTPase faoliyati;
Uyali komponent	• fagotsitik vazikula membranasi; • avtofagosoma membranasi; • hujayra proektsiyasi; • fagotsitik chashka; • hujayra membranasi; • membrana; • sitoplazmatik vazikula; • Golgi membranasi; • mitoxondriya; • Golgi apparati; • sitozol; • endoplazmatik to'r pardasi;
Biologik jarayon	• avtofagiya; • yallig'lanish reaktsiyasi; • immunitet tizimi jarayoni; • avtofagosoma yig'ilishi; • oqsil fosforillanishining ijobiy regulyatsiyasi; • otofagiyani ijobiy tartibga solish; • peptidil-treonin fosforillanishining ijobiy regulyatsiyasi; • oqsillarni barqarorlashtirish; • peptidil-serin fosforillanishining ijobiy regulyatsiyasi; • oqsil kompleksi yig'ilishini tartibga solish; • tug'ma immunitet tizimi; • oqsillarni barqarorlashtirish; • Gram-manfiy bakteriyaga qarshi himoya reaktsiyasi; • interferon-gamma vositachiligining signalizatsiya yo'lini ijobiy tartibga solish; • oqsil kompleksi barqarorligini tartibga solish; • avtofagosoma yig'ilishida ishtirok etadigan protein lipidatsiyasi; • CAMKK-AMPK signalizatsiya kaskadi; • 2 ta signal yo'lini o'z ichiga olgan nukleotidlarni bog'laydigan oligomerizatsiya maydoni; • lipopolisakkaridga uyali javob; • autofagosoma kamolotining ijobiy regulyatsiyasi; • oqsil serin / treonin kinaz faolligini ijobiy tartibga solish; • mudofaa javobi; • interferon-beta uchun uyali javob;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	345611
	54396
	ENSG00000237693
	ENSMUSG00000069874
	A1A4Y4
	Q9Z1M2
	NM_001145805; NM_001346557
	NM_019440
	NP_001139277; NP_001333486
	n / a
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Immunitet bilan bog'liq GTPaza oilasi M oqsili (IRGM), shuningdek, sifatida tanilgan interferonni keltirib chiqaradigan protein 1 (IFI1), an ferment odamlarda shunday IRGM gen.^[5]

IRGM a'zosi interferonni keltirib chiqaradigan GTPaza oila. Kodlangan oqsil tarkibida rol o'ynashi mumkin tug'ma immunitet reaktsiyasi tartibga solish orqali avtofagiya hujayra ichidagi patogenlarga javoban shakllanish.

Gen tomonidan o'chirilgan Alu elementi kamida 25 million yil davomida primat nasabga olib keladi maymunlar odamlar, shu jumladan, lekin u tomonidan qayta yoqilgan endogen retrovirus ERV-9 deb nomlangan.^[6]

Klinik ahamiyati

Ushbu genning normal ifodalanishiga ta'sir qiluvchi polimorfizmlar sezuvchanlik bilan bog'liq Crohn kasalligi va sil kasalligi.^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000237693 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000069874 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Entrez Gen: immunitet bilan bog'liq GTPase oilasi".
^ Bekpen C, Marques-Bonet T, Alkan C, Antonacci F, Leogrande MB, Ventura M va boshq. (Mart 2009). "Inson IRGM genining o'limi va tirilishi". PLOS Genetika. 5 (3): e1000403. doi:10.1371 / journal.pgen.1000403. PMC 2644816. PMID 19266026.
^ Preskott NJ, Dominy KM, Kubo M, Lyuis CM, Fisher SA, Redon R va boshq. (2010 yil may). "Kron kasalligi bilan IRGM lokusidagi xavf-xatar variantlarining mustaqil va aholiga bog'liq assotsiatsiyasi" (PDF). Inson molekulyar genetikasi. 19 (9): 1828–39. doi:10.1093 / hmg / ddq041. PMC 2850616. PMID 20106866.

Qo'shimcha o'qish

Laukens D, Georges M, Libioulle C, Sandor C, Mni M, Vander Cruyssen B va boshq. (2010 yil noyabr). "Kron kasalligi va ankilozan spondilitning umumiy xavf variantlari o'rtasida sezilarli darajada o'xshashlik borligiga dalillar". PLOS ONE. 5 (11): e13795. doi:10.1371 / journal.pone.0013795. PMC 2970560. PMID 21072187.
Xenkkaerts L, Van Stin K, Verstreken I, Kleynen I, Franke A, Shrayber S va boshq. (Sentyabr 2009). "Kron kasalligi bilan kasallangan bemorlarda genetik xavfni aniqlash va kasallikning borishini bashorat qilish". Klinik gastroenterologiya va gepatologiya. 7 (9): 972-980.e2. doi:10.1016 / j.cgh.2009.05.001. PMID 19422935.
Palomino-Morales RJ, Oliver J, Gomez-Garsiya M, Lopes-Nevot MA, Rodrigo L, Nieto A va boshq. (Iyun 2009). "ATG16L1 va IRGM genlarining polimorfizmlari bilan yallig'lanishli ichak kasalligi: meta-tahlil usuli". Genlar va immunitet. 10 (4): 356–64. doi:10.1038 / gen.2009.25. PMID 19491842.
Intemann CD, Thye T, Niemann S, Browne EN, Amanua Chinbuah M, Enimil A va boshq. (Sentyabr 2009). "IRGM -261T otofagiya geni varianti M. africanum shtammlari tomonidan emas, balki Mycobacterium tuberculosis tomonidan kelib chiqqan sil kasalligidan himoyalanishga yordam beradi". PLOS patogenlari. 5 (9): e1000577. doi:10.1371 / journal.ppat.1000577. PMC 2735778. PMID 19750224.
Che N, Li S, Gao T, Chjan Z, Xan Y, Chjan X va boshq. (2010 yil noyabr). "Silga aloqador yangi nukleotidli polimorfizmning yangi IRGM promouterini aniqlash". Clinica Chimica Acta; Xalqaro Klinik Kimyo jurnali. 411 (21–22): 1645–9. doi:10.1016 / j.cca.2010.06.009. PMID 20547146.
Dema B, Fernández-Arquero M, Maluenda C, Polanco I, Figueredo MA, de la Concha EG va boshq. (2009 yil noyabr). "NKX2-3, IRGM va ATG16L1 yallig'lanishli ichak kasalligi sezuvchanlik variantlarini çölyak kasalligi bilan birlashtirmaslik". Inson immunologiyasi. 70 (11): 946–9. doi:10.1016 / j.humimm.2009.08.004. PMID 19683022.
Zhang ZD, Frankish A, Hunt T, Harrow J, Gerstein M (2010). "Unitar pseudogenlarni aniqlash va tahlil qilish: odamlarda va boshqa primatlarda genlarning tarixiy va zamonaviy yo'qotilishi". Genom biologiyasi. 11 (3): R26. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r26. PMC 2864566. PMID 20210993.
Wolfkamp SC, Te Velde AA, Weersma RK, Ponsioen CY, Stokkers PC (avgust 2010). "Granulomalarni shakllantirishda Kron kasalligi bilan bog'liq bo'lgan ATG16L1 va IRGM autofagiya genlarining roli bormi?". Evropa Gastroenterologiya va Gepatologiya jurnali. 22 (8): 933–7. doi:10.1097 / MEG.0b013e32833775e6. PMID 20395867. S2CID 20331665.
Singh SB, Ornatowski V, Vergne I, Naylor J, Delgado M, Roberts E va boshq. (2010 yil dekabr). "Inson IRGM mitofondriya orqali autofagiya va hujayra-avtonom immunitet funktsiyalarini tartibga soladi". Tabiat hujayralari biologiyasi. 12 (12): 1154–65. doi:10.1038 / ncb2119. PMC 2996476. PMID 21102437.
Latiano A, Palmieri O, Corritore G, Valvano MR, Bossa F, Cucchiara S va boshq. (2010 yil iyul). "3p21 lokusidagi variantlar sezgirlik va fenotipga kattalarda ham, ichakning yallig'lanish kasalligi bilan erta boshlangan bemorlarda ham ta'sir qiladi". Ichakning yallig'lanish kasalliklari. 16 (7): 1108–17. doi:10.1002 / ibd.21176. PMID 20024904. S2CID 34309305.
Delgado M, Singh S, De Haro S, Master S, Ponpuak M, Dinkins C va boshq. (Yanvar 2009). "Tug'ma immunitetda autofagiya va naqshni aniqlash retseptorlari". Immunologik sharhlar. 227 (1): 189–202. doi:10.1111 / j.1600-065X.2008.00725.x. PMC 2788953. PMID 19120485.
Törkvist L, Halfvarson J, Ong RT, Lördal M, Sjokvist U, Bresso F va boshq. (Iyun 2010). "Shvetsiyadagi yallig'lanishli ichak kasalliklarida 39 ta Crohn kasalligi xavfini aniqlash". Ichakning yallig'lanish kasalliklari. 16 (6): 907–9. doi:10.1002 / ibd.21105. PMID 19760754.
Budarf ML, Goyette P, Boucher G, Lian J, Grem RR, Klaudio JO va boshq. (2011 yil yanvar). "Tizimli eritematozni maqsadli assotsiatsiyasida o'rganish ko'plab sezuvchanlik allellarini aniqladi". Genlar va immunitet. 12 (1): 51–8. doi:10.1038 / gen.2010.47. PMID 20962850.
Bekpen C, Xaver RJ, Eyxler EE (2010 yil dekabr). "Inson IRGM geni" bo'lishi yoki bo'lmasligi"". Immunopatologiya bo'yicha seminarlar. 32 (4): 437–44. doi:10.1007 / s00281-010-0224-x. PMID 20737271. S2CID 39006249.
Cleynen I, Mahachie John JM, Henckaerts L, Van Moerkercke V, Rutgeerts P, Van Steen K, Vermeire S (sentyabr 2010). "Kron kasalligini genetik variantlarni klasterli tahlil qilish orqali molekulyar qayta tasniflash". PLOS ONE. 5 (9): e12952. doi:10.1371 / journal.pone.0012952. PMC 2944846. PMID 20886065.
Wagner J, Sim WH, Ellis JA, Ong EK, Catto-Smith AG, Cameron DJ va boshq. (2010 yil noyabr). "Avstraliya pediatrik kogortasida Kron kasalligi sezuvchanligi genlarining o'zaro ta'siri". PLOS ONE. 5 (11): e15376. doi:10.1371 / journal.pone.0015376. PMC 2975706. PMID 21079743.
Meggyesi N, Kiss LS, Koszarska M, Bortlik M, Duricova D, Lakatos L va boshq. (2010 yil noyabr). "NKX2-3 va IRGM variantlari Sharqiy Evropa bemorlarida IBD kasalliklariga sezgirligi bilan bog'liq". Jahon Gastroenterologiya jurnali. 16 (41): 5233–40. doi:10.3748 / wjg.v16.i41.5233. PMC 2975094. PMID 21049557.

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasi ichida joylashgan jamoat mulki.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 5 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000237693 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000069874 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[entrez-5] "Entrez Gen: immunitet bilan bog'liq GTPase oilasi".

[6] Bekpen C, Marques-Bonet T, Alkan C, Antonacci F, Leogrande MB, Ventura M va boshq. (Mart 2009). "Inson IRGM genining o'limi va tirilishi". PLOS Genetika. 5 (3): e1000403. doi:10.1371 / journal.pgen.1000403. PMC 2644816. PMID 19266026.

[pmid20106866-7] Preskott NJ, Dominy KM, Kubo M, Lyuis CM, Fisher SA, Redon R va boshq. (2010 yil may). "Kron kasalligi bilan IRGM lokusidagi xavf-xatar variantlarining mustaqil va aholiga bog'liq assotsiatsiyasi" (PDF). Inson molekulyar genetikasi. 19 (9): 1828–39. doi:10.1093 / hmg / ddq041. PMC 2850616. PMID 20106866.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Fermentlar
Faoliyat	Faol sayt Majburiy sayt Katalitik uchlik Oksiyan teshigi Fermentlarning buzilishi Katalitik jihatdan mukammal ferment Koenzim Kofaktor Fermentlar katalizi
Tartibga solish	Allosterik regulyatsiya Hamkorlik Ferment inhibitori Ferment aktivatori
Tasnifi	EC raqami Superfamily ferment Fermentlar oilasi Fermentlar ro'yxati
Kinetika	Fermentlar kinetikasi Eadi-Xofsti diagrammasi Xanlar-Vulf fitnasi Lineweaver - Burk fitnasi Michaelis-Menten kinetikasi
Turlari	EC1 Oksidoreduktazalar (ro'yxat ) EC2 Transferazalar (ro'yxat ) EC3 Gidrolazalar (ro'yxat ) EC4 Lizalar (ro'yxat ) EC5 Izomerazalar (ro'yxat ) EC6 Ligazlar (ro'yxat ) EC7 Translokaza (ro'yxat )