HEPN domeni - HEPN domain
| HEPN domeni | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 tb1696 kristalli tuzilishi hb8 termofilus termofilidan | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | HEPN | ||||||||
| Pfam | PF05168 | ||||||||
| Pfam klan | CL0291 | ||||||||
| InterPro | IPR007842 | ||||||||
| SCOP2 | 1o3u / QOIDA / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Molekulyar biologiyada HEPN domeni (yuqoriroq eukaryotlar va prokaryotlar nukleotid - majburiy domen ) taxminan 110 ga teng mintaqadir aminokislotalar topilgan C terminusi ning saksin, a shaperonin erta boshlanishiga aloqador neyrodejenerativ kasallik insonda va ko'pchilikda bakterial va arxey oqsillar. HEPN domenlari bo'lgan uchta oqsil sinflari mavjud:
- Yagona domenli HEPN oqsillar ko'plab bakteriyalarda mavjud.
- Ikki domenli oqsillar N-terminal bilan nukleotidiltransferaza (NT) va C - terminal HEPN domenlar. Ushbu N-terminal NT domeni bir nechta sinflarni o'z ichiga olgan katta NT oilasiga tegishli fermentlar ba'zi turlari uchun javobgardir bakterial qarshilik aminoglikozidlar. Ushbu fermentlar turli xillarni faolsizlantiradi antibiotiklar o'tkazish orqali nukleotidil guruhga dori.
- In ichida ko'p miqdordagi saksin oqsili genomlar ning baliq va sutemizuvchilar. HEPN domeni to'g'ridan-to'g'ri DnaJ domenidan keyin oqsilning C uchida joylashgan. The kristall tuzilishi ning TM0613 oqsilidan HEPN domeni Termotoga maritima ekanligini ko'rsatadi tizimli ravishda C-terminaliga o'xshashalfa-spiral domeni kanamitsin nukleotidiltransferazalari (KNTases). U beshta alfa spiraldan iborat bo'lib, ularning uchtasi yuqoriga va pastga spiral to'plamni hosil qiladi, jufti esa qisqa spirallar yon tomonda. Uzoq tarkibiy o'xshashlik, HEPN domeni nukleotidlarni bog'lashda ishtirok etishi mumkinligini ko'rsatadi.[1]
Adabiyotlar
- ^ Grynberg M, Erlandsen H, Godzik A (2003 yil may). "HEPN: bakterial dorilarga chidamliligi va odamning neyrodejenerativ oqsillari umumiy sohasi". Biokimyo tendentsiyalari. Ilmiy ish. 28 (5): 224–6. doi:10.1016 / S0968-0004 (03) 00060-4. PMID 12765831.